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Phylogenetic Tree for
Panicum virgatum
HD-ZIP Family
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      Subtree rooted at node 160:

                                                                    /----- Pavir.1NG023300.1.p/124-178 (2)
                                                               /-100+                 
                                                               |    \----- Pavir.1KG047300.1.p/125-179 (73)
                /----------------------100---------------------+                      
                |                                              |    /----- Pavir.4KG379700.1.p/92-146  (13)
                |                                              \-91-+                 
                |                                                   \----- Pavir.4NG305300.1.p/94-148  (23)
                |                                                                     
                |--------------------------------------------------------- Pavir.1KG361200.1.p/195-249 (3)
                |                                                                     
                |                                                   /----- Pavir.2NG330800.1.p/241-296 (4)
                |                                                   |                 
                |                                              /-100+----- Pavir.2KG313900.1.p/236-291 (15)
                |                                              |    |                 
                |                                              |    \----- Pavir.9NG827800.1.p/92-147  (20)
                |                                         /-91-+                      
                |                                         |    |    /----- Pavir.6NG116700.1.p/80-133  (28)
                |                                         |    \-79-+                 
                |                    /---------88---------+         \----- Pavir.6KG248200.1.p/79-132  (65)
                |                    |                    |                           
                |                    |                    |         /----- Pavir.1NG403300.1.p/74-127  (68)
                |                    |                    \----94---+                 
                |                    |                              \----- Pavir.1KG493900.1.p/75-128  (90)
                |                    |                                                
                |                    |                              /----- Pavir.9KG266900.1.p/70-123  (10)
                |                    |                         /-97-+                 
                |                    |                         |    \----- Pavir.9KG252400.1.p/70-123  (63)
                |                    |                         |                      
                |                    |                    /-100+---------- Pavir.9NG377600.1.p/69-122  (30)
                |                    |                    |    |                      
                |                    |                    |    \---------- Pavir.4KG101800.1.p/69-122  (33)
                |                    |              /-100-+                           
                |                    |              |     |         /----- Pavir.9NG815600.1.p/66-119  (11)
                |                    |              |     \---100---+                 
                |                    |         /-82-+               \----- Pavir.9KG646700.1.p/69-121  (40)
                |                    |         |    |                                 
                |                    |         |    |               /----- Pavir.6NG280000.1.p/56-109  (48)
                |          /----69---+         |    \------100------+                 
                |          |         |    /-85-+                    \----- Pavir.6KG312500.1.p/55-108  (70)
                |          |         |    |    |                                      
                |          |         |    |    |-------------------------- Pavir.2NG401700.1.p/49-102  (62)
                |          |         |    |    |                                      
                |          |         |    |    \-------------------------- Pavir.J245000.1.p/49-102    (76)
                |          |         |-91-+                                           
                |          |         |    |                         /----- Pavir.9NG729300.1.p/113-166 (41)
                |          |         |    |                         |                 
                |          |         |    |                    /-100+----- Pavir.9KG609800.1.p/112-165 (72)
                |          |         |    |                    |    |                 
                |          |         |    \---------100--------+    \----- Pavir.9KG608700.1.p/112-165 (78)
                |          |         |                         |                      
                |          |         |                         \---------- Pavir.9NG314000.1.p/137-189 (57)
                |          |         |                                                
                |          |         |                              /----- Pavir.2KG510000.1.p/55-108  (22)
                |          |         |                         /-100+                 
                |          |         |                         |    \----- Pavir.2NG558700.1.p/57-110  (27)
                |          |         \-----------100-----------+                      
                |          |                                   |    /----- Pavir.9KG637900.1.p/58-111  (36)
                |          |                                   \-100+                 
                |          |                                        \----- Pavir.9NG658500.1.p/58-111  (94)
                |          |                                                          
                |          |                                        /----- Pavir.J583200.1.p/132-187   (7)
                |          |                                        |                 
                |          |                                   /-100+----- Pavir.2NG431600.1.p/132-187 (25)
                |          |                                   |    |                 
                |          |                                   |    \----- Pavir.2NG392300.1.p/133-188 (69)
                |          |                              /-70-+                      
                |          |                              |    |    /----- Pavir.5KG129400.1.p/104-159 (26)
                |          |                              |    |    |                 
                |          |                              |    \-100+----- Pavir.5KG139200.1.p/104-159 (43)
                |          |                        /--59-+         |                 
                |          |                        |     |         \----- Pavir.5NG136300.1.p/104-159 (55)
                |          |                        |     |                           
                |          |                        |     |         /----- Pavir.7KG302300.1.p/99-155  (51)
                |          |                        |     \---100---+                 
                |          |                   /-50-+               \----- Pavir.7NG292900.1.p/77-133  (54)
                |          |                   |    |                                 
                |          |                   |    |               /----- Pavir.4KG178100.1.p/19-73   (45)
                |          |                   |    |          /-100+                 
                |          |                   |    |          |    \----- Pavir.4NG124800.1.p/20-75   (61)
                |          |                   |    \----79----+                      
                |          |                   |               |    /----- Pavir.1NG485100.1.p/17-72   (58)
                |          |                   |               \-50-+                 
                |    /--98-+                   |                    \----- Pavir.1NG532800.1.p/17-72   (77)
                |    |     |                   |                                      
                |    |     |                   |                    /----- Pavir.7KG395300.1.p/105-161 (34)
                |    |     |                   |                    |                 
                |    |     |                   |                    |----- Pavir.6NG083100.1.p/100-156 (42)
                |    |     |              /-80-+                    |                 
           /-69-+    |     |              |    |               /-65-+----- Pavir.6NG030900.1.p/120-175 (60)
           |    |    |     |              |    |               |    |                 
           |    |    |     |              |    |               |    |----- Pavir.7NG364900.1.p/99-155  (82)
           |    |    |     |              |    |-------53------+    |                 
           |    |    |     |              |    |               |    \----- Pavir.6KG093100.1.p/1-43    (91)
           |    |    |     |              |    |               |                      
           |    |    |     |              |    |               \---------- Pavir.5NG535600.1.p/105-157 (79)
           |    |    |     |              |    |                                      
           |    |    |     |              |    |                    /----- Pavir.5KG553000.1.p/1-42    (52)
           |    |    |     |              |    |               /-100+                 
           |    |    |     |         /-94-+    |               |    \----- Pavir.5KG554500.1.p/90-145  (95)
           |    |    |     |         |    |    \-------53------+                      
           |    |    |     |         |    |                    |    /----- Pavir.7KG090800.1.p/137-192 (74)
           |    |    |     |         |    |                    \-91-+                 
           |    |    |     |         |    |                         \----- Pavir.9KG230900.1.p/131-186 (83)
           |    |    |     |         |    |                                           
           |    |    |     |         |    |                         /----- Pavir.7NG015800.1.p/70-121  (21)
           |    |    |     |         |    |               /---100---+                 
           |    |    |     |         |    |               |         \----- Pavir.7KG111500.1.p/70-121  (31)
           |    |    |     |         |    |               |                           
           |    |    |     |         |    \-------70------+         /----- Pavir.2KG245800.1.p/2-42    (32)
           |    |    |     |         |                    |    /-100+                 
           |    |    |     |         |                    |    |    \----- Pavir.2NG276500.1.p/3-42    (47)
           |    |    |     |         |                    \-71-+                      
           |    |    |     |    /-100+                         \---------- Pavir.7KG109200.1.p/73-124  (56)
           |    |    |     |    |    |                                                
           |    |-58-+     |    |    |                         /---------- Pavir.3NG283000.1.p/23-80   (16)
           |    |    |     |    |    |                         |                      
           |    |    |     |    |    |                         |---------- Pavir.3KG537000.1.p/23-80   (17)
           |    |    |     |    |    |                    /-73-+                      
           |    |    |     |    |    |                    |    |    /----- Pavir.5NG049400.1.p/15-73   (67)
           |    |    |     |    |    |                    |    |    |                 
           |    |    |     |    |    |                    |    \-100+----- Pavir.5NG046500.1.p/15-73   (71)
           |    |    |     |    |    |                    |         |                 
           |    |    |     |    |    |                    |         \----- Pavir.5KG046400.1.p/15-73   (86)
           |    |    |     |    |    |                    |                           
           |    |    |     |    |    |                    |         /----- Pavir.9NG791600.1.p/27-85   (19)
           |    |    |     |    |    \---------100--------+    /-100+                 
           |    |    |     \-93-+                         |    |    \----- Pavir.9KG558300.1.p/28-86   (87)
           |    |    |          |                         |-83-+                      
           |    |    |          |                         |    \---------- Pavir.9KG182300.1.p/28-85   (93)
           |    |    |          |                         |                           
           |    |    |          |                         |--------------- Pavir.9KG074600.1.p/30-87   (24)
           |    |    |          |                         |                           
           |    |    |          |                         \--------------- Pavir.9NG188400.1.p/30-87   (29)
      --100+    |    |          |                                                     
           |    |    |          |                                   /----- Pavir.2NG429100.1.p/31-85   (9)
           |    |    |          |                   /------100------+                 
           |    |    |          |                   |               \----- Pavir.2NG446200.1.p/33-87   (49)
           |    |    |          |                   |                                 
           |    |    |          |                   |               /----- Pavir.J677700.1.p/49-102    (53)
           |    |    |          \---------95--------+          /-100+                 
           |    |    |                              |          |    \----- Pavir.1KG414100.1.p/53-106  (81)
           |    |    |                              |     /-82-+                      
           |    |    |                              |     |    \---------- Pavir.7KG269700.1.p/59-112  (59)
           |    |    |                              \--97-+                           
           |    |    |                                    \--------------- Pavir.7NG265400.1.p/61-114  (75)
           |    |    |                                                                
           |    |    \---------------------------------------------------- Pavir.3KG212300.1.p/73-127  (80)
           |    |                                                                     
           |    |                                                   /----- Pavir.5NG261700.1.p/80-133  (5)
           |    |------------------------100------------------------+                 
           |    |                                                   \----- Pavir.5KG455800.1.p/77-130  (85)
           |    |                                                                     
           |    |                                              /---------- Pavir.9KG239900.1.p/95-149  (6)
           |    |                                              |                      
           |    |                                              |---------- Pavir.9NG369700.1.p/97-151  (46)
           |    |----------------------89----------------------+                      
           |    |                                              |    /----- Pavir.J202900.1.p/112-164   (64)
           |    |                                              \-100+                 
           |    |                                                   \----- Pavir.9KG100100.1.p/107-159 (92)
           |    |                                                                     
           |    |                                                   /----- Pavir.9KG334700.1.p/169-223 (8)
           |    |-------------------------89------------------------+                 
           |    |                                                   \----- Pavir.9NG464700.1.p/167-221 (84)
           |    |                                                                     
           |    |                                                   /----- Pavir.2NG348500.1.p/165-219 (12)
           |    |                                              /-100+                 
           |    |                                              |    \----- Pavir.2NG344500.1.p/170-224 (88)
           |    |                                              |                      
           |    |----------------------59----------------------+---------- Pavir.6KG296200.1.p/311-365 (37)
           |    |                                              |                      
           |    |                                              \---------- Pavir.6NG247900.1.p/167-221 (44)
           |    |                                                                     
           |    |                                                   /----- Pavir.1NG305200.1.p/234-288 (38)
           |    \-------------------------72------------------------+                 
           |                                                        \----- Pavir.8KG105500.1.p/106-160 (89)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Pavir.7KG277200.1.p/75-129  (18)
           \---------------------------97---------------------------+                 
                                                                    \----- Pavir.7NG272300.1.p/73-127  (50)
                                                                                      
      Root part of tree:

      /------------------------------------------------------------------- Pavir.4KG026000.1.p/88-142  (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Pavir.4KG023900.1.p/90-144  (14)
      |                                                                               
      +                                 /--------------------------------- (160)
      |                                 |                                             
      |                                 |--------------------------------- Pavir.4NG039700.1.p/114-168 (35)
      \---------------100---------------+                                             
                                        |--------------------------------- Pavir.4KG024100.1.p/125-179 (39)
                                        |                                             
                                        \--------------------------------- Pavir.4KG026100.1.p/158-212 (66)
                                                                                      

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      Subtree rooted at node 172:

                                                                    /----- Pavir.J677700.1.p   (2)
                                                               /-100+                 
                                                               |    \----- Pavir.1KG414100.1.p (41)
                                                          /-95-+                      
                                                          |    |    /----- Pavir.7KG269700.1.p (31)
                                                          |    \-100+                 
                                     /---------100--------+         \----- Pavir.7NG265400.1.p (79)
                                     |                    |                           
                                     |                    |         /----- Pavir.2NG429100.1.p (86)
                                     |                    \---100---+                 
                                     |                              \----- Pavir.2NG446200.1.p (94)
                                     |                                                
                                     |                              /----- Pavir.9KG252400.1.p (15)
                                     |                         /-100+                 
                                     |                         |    \----- Pavir.9KG266900.1.p (72)
                                     |                    /-100+                      
                                     |                    |    |    /----- Pavir.9NG377600.1.p (19)
                                     |                    |    \-100+                 
                                     |         /----100---+         \----- Pavir.4KG101800.1.p (50)
                                     |         |          |                           
                                     |         |          |         /----- Pavir.9NG815600.1.p (45)
                                     |         |          \---100---+                 
                                /-98-+         |                    \----- Pavir.9KG646700.1.p (49)
                                |    |         |                                      
                                |    |         |                    /----- Pavir.9KG609800.1.p (17)
                                |    |         |               /-92-+                 
                                |    |    /-52-+               |    \----- Pavir.9KG608700.1.p (93)
                                |    |    |    |          /-100+                      
                                |    |    |    |          |    \---------- Pavir.9NG729300.1.p (82)
                                |    |    |    |    /-100-+                           
                                |    |    |    |    |     \--------------- Pavir.9NG314000.1.p (65)
                                |    |    |    |    |                                 
                                |    |    |    |    |               /----- Pavir.1NG403300.1.p (33)
                                |    |    |    |    |          /-100+                 
                                |    |    |    \-99-+          |    \----- Pavir.1KG493900.1.p (83)
                                |    |    |         |     /-100+                      
                                |    |    |         |     |    |    /----- Pavir.6KG248200.1.p (36)
                                |    |    |         |     |    \-100+                 
                                |    \-80-+         |     |         \----- Pavir.6NG116700.1.p (37)
                                |         |         \-100-+                           
                     /----99----+         |               |         /----- Pavir.9NG827800.1.p (58)
                     |          |         |               |    /-85-+                 
                     |          |         |               |    |    \----- Pavir.2NG330800.1.p (75)
                     |          |         |               \-100+                      
                     |          |         |                    \---------- Pavir.2KG313900.1.p (61)
                     |          |         |                                           
                     |          |         |                         /----- Pavir.2NG401700.1.p (29)
                     |          |         |                    /-100+                 
                     |          |         |                    |    \----- Pavir.J245000.1.p   (57)
                     |          |         \---------100--------+                      
                     |          |                              |    /----- Pavir.6NG280000.1.p (42)
                     |          |                              \-100+                 
                     |          |                                   \----- Pavir.6KG312500.1.p (56)
                     |          |                                                     
                     |          |                                   /----- Pavir.2KG510000.1.p (6)
                     |          |                              /-100+                 
                     |          |                              |    \----- Pavir.2NG558700.1.p (38)
                     |          \--------------100-------------+                      
                     |                                         |    /----- Pavir.9KG637900.1.p (12)
                     |                                         \-100+                 
                     |                                              \----- Pavir.9NG658500.1.p (21)
                     |                                                                
                     |                                         /---------- Pavir.7KG109200.1.p (4)
                     |                                         |                      
                     |                                    /-100+    /----- Pavir.7NG015800.1.p (24)
                     |                                    |    \-100+                 
                     |                                    |         \----- Pavir.7KG111500.1.p (43)
                     |                    /------100------+                           
                     |                    |               |         /----- Pavir.2NG276500.1.p (78)
                     |                    |               \---100---+                 
                     |                    |                         \----- Pavir.2KG245800.1.p (80)
                     |                    |                                           
                     |                    |                         /----- Pavir.6KG093100.1.p (9)
                     |                    |                    /-100+                 
                     |                    |                    |    \----- Pavir.6NG083100.1.p (60)
                     |                    |               /-100+                      
                     |                    |               |    |    /----- Pavir.7KG395300.1.p (62)
                     |                    |               |    \-100+                 
                     |                    |         /-100-+         \----- Pavir.7NG364900.1.p (95)
                     |                    |         |     |                           
                     |                    |         |     \--------------- Pavir.6NG030900.1.p (28)
                     |                    |         |                                 
                     |                    |         |               /----- Pavir.1NG485100.1.p (25)
                /-93-+                    |    /-77-+          /-100+                 
                |    |                    |    |    |          |    \----- Pavir.1NG532800.1.p (87)
                |    |                    |    |    |     /-100+                      
                |    |                    |    |    |     |    |    /----- Pavir.4NG124800.1.p (67)
                |    |                    |    |    |     |    \-100+                 
                |    |                    |    |    \--99-+         \----- Pavir.4KG178100.1.p (68)
                |    |               /-62-+    |          |                           
                |    |               |    |    |          |         /----- Pavir.7KG090800.1.p (30)
                |    |               |    |    |          \---100---+                 
                |    |               |    |-50-+                    \----- Pavir.9KG230900.1.p (48)
                |    |               |    |    |                                      
                |    |               |    |    |                    /----- Pavir.J583200.1.p   (10)
                |    |               |    |    |               /-99-+                 
                |    |               |    |    |               |    \----- Pavir.2NG431600.1.p (88)
                |    |               |    |    |    /----100---+                      
                |    |               |    |    |    |          \---------- Pavir.2NG392300.1.p (18)
                |    |               |    |    |    |                                 
                |    |               |    |    |    |               /----- Pavir.7NG292900.1.p (13)
                |    |               |    |    \-53-+     /---100---+                 
                |    |          /-63-+    |         |     |         \----- Pavir.7KG302300.1.p (90)
                |    |          |    |    |         |     |                           
                |    |          |    |    |         \-100-+         /----- Pavir.5KG129400.1.p (22)
                |    |          |    |    |               |    /-100+                 
                |    |          |    |    |               |    |    \----- Pavir.5KG139200.1.p (71)
                |    |          |    |    |               \-100+                      
                |    |          |    |    |                    \---------- Pavir.5NG136300.1.p (64)
                |    |          |    |    |                                           
                |    |          |    |    |                         /----- Pavir.5KG554500.1.p (77)
                |    |          |    |    \-----------100-----------+                 
           /-59-+    |          |    |                              \----- Pavir.5KG553000.1.p (91)
           |    |    |          |    |                                                
           |    |    |          |    \------------------------------------ Pavir.5NG535600.1.p (35)
           |    |    |     /-64-+                                                     
           |    |    |     |    |                                   /----- Pavir.3KG537000.1.p (7)
           |    |    |     |    |                              /-100+                 
           |    |    |     |    |                              |    \----- Pavir.3NG283000.1.p (26)
           |    |    |     |    |                         /-100+                      
           |    |    |     |    |                         |    |    /----- Pavir.9KG074600.1.p (27)
           |    |    |     |    |                         |    \-100+                 
           |    |    |     |    |                         |         \----- Pavir.9NG188400.1.p (39)
           |    |    |     |    |                   /-100-+                           
           |    |    |     |    |                   |     |         /----- Pavir.9NG791600.1.p (8)
           |    |    |     |    |                   |     |    /-100+                 
           |    |    \--97-+    |                   |     |    |    \----- Pavir.9KG558300.1.p (46)
           |    |          |    |                   |     \-100+                      
           |    |          |    \--------100--------+          \---------- Pavir.9KG182300.1.p (52)
           |    |          |                        |                                 
           |    |          |                        |          /---------- Pavir.5KG046400.1.p (40)
           |    |          |                        |          |                      
           |    |          |                        \----100---+    /----- Pavir.5NG049400.1.p (63)
           |    |          |                                   \-100+                 
           |    |          |                                        \----- Pavir.5NG046500.1.p (70)
           |    |          |                                                          
           |    |          \---------------------------------------------- Pavir.3KG212300.1.p (76)
           |    |                                                                     
      --53-+    |                                                   /----- Pavir.9KG334700.1.p (20)
           |    |                                              /-100+                 
           |    |                                              |    \----- Pavir.9NG464700.1.p (44)
           |    \----------------------72----------------------+                      
           |                                                   |    /----- Pavir.7KG277200.1.p (47)
           |                                                   \-100+                 
           |                                                        \----- Pavir.7NG272300.1.p (74)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Pavir.4KG023900.1.p (3)
           |                                              /---100---+                 
           |                                              |         \----- Pavir.4KG026000.1.p (53)
           |                                              |                           
           |----------------------100---------------------+         /----- Pavir.4KG026100.1.p (23)
           |                                              |    /-65-+                 
           |                                              |    |    \----- Pavir.4KG024100.1.p (66)
           |                                              \-100+                      
           |                                                   \---------- Pavir.4NG039700.1.p (85)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Pavir.1NG305200.1.p (16)
           |---------------------------100--------------------------+                 
           |                                                        \----- Pavir.1KG361200.1.p (92)
           |                                                                          
           |-------------------------------------------------------------- Pavir.8KG105500.1.p (32)
           |                                                                          
           |                                                        /----- Pavir.5NG261700.1.p (54)
           \---------------------------100--------------------------+                 
                                                                    \----- Pavir.5KG455800.1.p (81)
                                                                                      
      Root part of tree:

      /------------------------------------------------------------------- Pavir.J202900.1.p   (1)
      |                                                                               
      |------------------------------------------------------------------- Pavir.9KG100100.1.p (59)
      |                                                                               
      |                                 /--------------------------------- (172)
      |                                 |                                             
      |                                 |                     /----------- Pavir.2NG344500.1.p (11)
      |                     /-----89----+          /----100---+                       
      |                     |           |          |          \----------- Pavir.2NG348500.1.p (34)
      +                     |           \----100---+                                  
      |                     |                      |          /----------- Pavir.6NG247900.1.p (51)
      |                     |                      \----100---+                       
      |          /----100---+                                 \----------- Pavir.6KG296200.1.p (73)
      |          |          |                                                         
      |          |          |                                 /----------- Pavir.4KG379700.1.p (5)
      |          |          |                      /----100---+                       
      |          |          |                      |          \----------- Pavir.4NG305300.1.p (84)
      |          |          \----------100---------+                                  
      \----100---+                                 |          /----------- Pavir.1NG023300.1.p (14)
                 |                                 \----100---+                       
                 |                                            \----------- Pavir.1KG047300.1.p (69)
                 |                                                                    
                 |                                            /----------- Pavir.9NG369700.1.p (55)
                 \---------------------100--------------------+                       
                                                              \----------- Pavir.9KG239900.1.p (89)